8 سالہ دفاعِ مقدس کے دوران ایران کے 40,214 اہلکار دشمن کی قید میں آئے جبکہ عراق کے 68,245 اہلکار ایران کے قیدی بنے۔

دونوں اطراف کے قیدیوں کا تبادلہ 1981 سے 2003 تک تین ادوار میں اور 140 مراحل میں مکمل ہوا۔

ایران کے وہ مجاہدین جو دشمن کی قید میں تھے، 78 مراحل میں 16 جون 1981 سے 16 مارچ 2004 تک وطن واپس پہنچے۔ اس مدت کے دوران 574 افراد انتقال کر گئے یا شہید ہوئے اور 500 افراد نے پناہ حاصل کر لی۔⁠[1]

اسی عرصے میں، ایران میں موجود 68,245 عراقی قیدیوں میں سے ایک بڑی تعداد 120 مراحل میں اپنے ملک واپس پہنچی۔ 10,336 عراقی قیدیوں نے ایران میں پناہ لی اور جمہوری اسلامی ایران کی شہریت حاصل کر لی۔ ان میں سے 1,214 افراد کا انتقال ہوا جن کی میتیں عراقی حکام کے حوالے کر دی گئیں۔⁠[2]

ایران اور عراق کے درمیان قیدیوں کا تبادلہ تین مراحل میں انجام پایا۔ پہلے مرحلے میں، حکومتِ عراق کی جانب سے رہا کیے گئے ایرانی قیدیوں میں سے تقریباً آدھے وہ شہری تھے جنہیں جنگ کے ابتدائی دنوں میں ملک کے جنوبی سرحدی دیہاتوں سے جارح افواج نے قید کیا تھا، یا ان میں سے کچھ کو کردستان میں کوملہ اور ڈیموکریٹ جیسے مخالف گروہوں نے اغوا کر کے عراقیوں کے ہاتھ فروخت کر دیا تھا۔ اس دور کے قیدیوں میں 23 خواتین بھی شامل تھیں جن میں زیادہ تر سرحدی علاقوں کی عام شہری خواتین اور 5 امدادی کارکن تھیں۔ اس مرحلے میں متعدد زخمیوں اور معذوروں کو بھی رہا کیا گیا۔ یہ قیدی ریڈ کراس (صلیبِ سرخ) کے نمائندوں کی نگرانی میں مہر آباد ایئرپورٹ، ترکی کے شہر انقرہ، قبرص کے شہر لارناکا اور خسروی-منذریہ سرحد پر ایرانی حکام کے حوالے کیے گئے۔⁠[3]

دوسرا مرحلہ، 18 جولائی 1988 کو جمہوری اسلامی ایران کی جانب سے اقوامِ متحدہ کی سلامتی کونسل کی قرارداد 598 کی منظوری اور اس کے نتیجے میں 6 اگست 1988 کو عراق کی جانب سے قرارداد قبول کیے جانے اور جنگ کے خاتمے کے ساتھ شروع ہوا۔ قرارداد کی منظوری کے بعد اور جنگ بندی کے قیام سے پہلے، اقوامِ متحدہ کے ایک تین رکنی وفد نے 24 جولائی سے 4 اگست 1988 تک گیارہ دنوں کے لیے قیدیوں کی واپسی اور تبادلے کے مسئلے کا جائزہ لینے کے لیے ایران اور عراق کا دورہ کیا اور اپنی رپورٹ میں اس بات پر زور دیا کہ فریقین کی نیک نیتی، اقوامِ متحدہ کے سیکرٹری جنرل کی مشاورت اور ریڈ کراس کی رہنمائی سے قیدیوں کی واپسی کا عمل شروع کیا جا سکتا ہے۔ اقوامِ متحدہ کے سیکرٹری جنرل نے سلامتی کونسل میں اعلان کیا کہ اس قرارداد کی تیسری شق تقاضا کرتی ہے کہ جنگی قیدیوں کو دشمنی کے خاتمے کے فوراً بعد رہا اور واپس کیا جائے، لیکن ایران اور عراق کے جنگی قیدیوں کی واپسی کا عمل قرارداد کی پیش گوئی کے مطابق انجام نہ پا سکا اور ایک مبہم و پیچیدہ صورتحال کا شکار ہو گیا جو کہ بنیادی طور پر قرارداد کی دفعات کی کمزوری اور ' نہ جنگ، نہ امن' جیسی شرائط کا نتیجہ تھا۔ قرارداد پر عمل درآمد میں عراقی حکومت کی رکاوٹوں کے باعث امن مذاکرات تعطل کا شکار ہو گئے اور قیدیوں کی آزادی و تبادلہ بھی کچھ عرصے کے لیے ملتوی ہو گیا۔ آخر کار صدام حسین اور (صدر) اکبر ہاشمی رفسنجانی کے درمیان خط و کتابت کے بعد، اگست 1990 میں دونوں فریقین نے قرارداد 598 پر عمل درآمد، 1975 کے الجزائر معاہدے میں درج بین الاقوامی سرحدوں تک پیچھے ہٹنے اور حسنِ جوار پر اتفاق کیا، اور اس معاہدے کے بعد قیدیوں کا تبادلہ شروع ہوا۔⁠[4]

تبادلے کے دوسرے دور میں قیدیوں کو خسروی-منذریہ سرحد اور مہر آباد ایئرپورٹ پر ایرانی حکام کے حوالے کیا گیا۔ یہ تبادلہ 42 مراحل میں ہوا جس کا پہلا مرحلہ 17 اگست 1990 کو خسروی-منذریہ سرحد پر 1,272 افراد کی واپسی کے ساتھ انجام پایا اور قیدیوں کو ریڈ کراس کے نمائندوں کے ذریعے ایرانی حکام کے حوالے کیا گیا۔⁠[5]

تبادلے کے تیسرے دور میں جو 1990 سے 2003 تک جاری رہا، 639 افراد کو 17 مراحل میں عراقی حکام نے ریڈ کراس کے نمائندوں کی نگرانی میں ایرانی حکام کے حوالے کیا۔

تبادلے کے اس مرحلے کے اختتام پر، دسمبر 2003 میں زندہ ایرانی اور عراقی قیدیوں کی فائل بند کر دی گئی اور ریڈ کراس، عراق اور ایران کے حکام نے اس بات پر اتفاق کیا کہ اب دونوں ملکوں میں کوئی بھی زندہ ایرانی یا عراقی قیدی موجود نہیں ہے۔⁠[6]

میجر جنرل حسین لشکری (شہید)، جو جمہوری اسلامی ایران کی فضائیہ کے پائلٹ تھے، وہ آخری قیدی تھے جو ایران اور عراق کے درمیان قیدیوں کے تبادلے کے دوران وطن واپس آئے۔⁠[7]

1981 سے 2003 تک عراقی قیدیوں کے تبادلے کی تفصیلات حسبِ ذیل ہیں:

1- 1981: 62 افراد دو مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: لارناکا ایئرپورٹ (قبرص) - مہر آباد ایئرپورٹ (تہران) ۔

2- 1983: 32 افراد ایک مرحلے میں؛ مقامِ حوالگی: انقرہ ایئرپورٹ (ترکی) ۔

3- 1984: 99 افراد دو مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: انقرہ ایئرپورٹ (ترکی) - مہر آباد ایئرپورٹ (تہران) ۔

4- 1985: 294 افراد چار مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: انقرہ ایئرپورٹ (ترکی) - مہر آباد ایئرپورٹ (تہران) ۔

5- 1986: 76 افراد ایک مرحلے میں؛ مقامِ حوالگی: مہر آباد ایئرپورٹ (تہران) ۔

6- 1987: 129 افراد دو مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: مہر آباد ایئرپورٹ (تہران) ۔

7- 1988: 485 افراد آٹھ مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: مہر آباد ایئرپورٹ (تہران) ۔

8- 1989: 165 افراد تین مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: مہر آباد ایئرپورٹ (تہران) ۔

9- 1990: 41,205 افراد 58 مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: مہر آباد ایئرپورٹ (تہران)؛ خسروی-منذریہ سرحد۔

10- 1991: 421 افراد ایک مرحلے میں؛ مقامِ حوالگی: خسروی-منذریہ سرحد۔

11- 1993: 103 افراد دو مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: خسروی-منذریہ سرحد۔

12- 1994: 1 فرد ایک مرحلے میں؛ مقامِ حوالگی: خسروی-منذریہ سرحد۔

13- 1995: 100 افراد ایک مرحلے میں؛ مقامِ حوالگی: خسروی-منذریہ سرحد۔

14- 1996: 871 افراد دو مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: خسروی-منذریہ سرحد۔

15- 1997: 542 افراد دو مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: خسروی-منذریہ سرحد۔

16- 1998: 6,248 افراد گیارہ مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: خسروی-منذریہ سرحد۔

17- 1999: 276 افراد دو مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: خسروی-منذریہ سرحد۔

18- 2000: 4,118 افراد دس مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: خسروی-منذریہ سرحد۔

19- 2001: 507 افراد دو مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: خسروی-منذریہ سرحد۔

20- 2002: 902 افراد چار مراحل میں؛ مقامِ حوالگی: خسروی-منذریہ سرحد۔

21- 2003: 59 افراد ایک مرحلے میں؛ مقامِ حوالگی: خسروی-منذریہ سرحد۔

دستاویزات کے مطابق، صدام حسین نے جنگ کے بعض مراحل میں جھوٹی خبریں بھی پھیلائیں کہ کچھ ایرانی قیدیوں کو رہا کر کے ریڈ کراس کے حوالے کر دیا گیا ہے، تاکہ اس طرح وہ دنیا کے سامنے خود کو ایک امن پسند شخصیت کے طور پر پیش کر سکے، حالانکہ حقیقت میں ایرانی حکام کو قیدیوں کی حوالگی کی کوئی اطلاع نہیں ہوتی تھی۔⁠[8]